Este Real Decreto ha sido modificado ligeramente en dos ocasiones:
-Real Decreto 534/2013, de 12 de julio, que modifica el apartado 7 del artículo 14, relativo a la calificación global concedida a la tesis y la disposición transitoria primera, relativa a la adaptación y extinción de los programas de doctorado verificados conforme a lo establecido en el Real Decreto 1393/2007, de 29 de octubre.
-Real Decreto 43/2015, de 2 de febrero, que modifica el apartado 1 del artículo 6, relativo a los requisitos de acceso al doctorado.