El Colegio Mayor «Fray Luis de León» dispone de un total de 90 plazas: 30 habitaciones individuales, 8 individuales con baño compartido y 26 dobles. Todas las habitaciones cuentan con cuarto de baño completo, cama, nevera, mesa de estudio, estanterías, armarios empotrados, espejo, sillas, lámpara de escritorio, corchera, calefacción, acceso a Internet vía Wifi, teléfono y ventanas con vistas a las Catedrales o a la Plaza Fray Luis de León. Se realiza la limpieza de las habitaciones de lunes a viernes.

Entre los servicios y espacios comunes con los que cuenta el Mayor, podemos enumerar los siguientes:

• Servicio de gimnasio gratuito en el "Centro de Acondicionamiento Físico - Peñuelas".
• Comedor Universitario todos los días de la semana.
• Servicio de impresión gratuita de trabajos y apuntes.
• Biblioteca con préstamo de libros.
• Servicio de limpieza de habitaciones de lunes a viernes.
• Cafetería de lunes a sábado.
• Videoteca con préstamo de DVD.
• Sala de Estudio.
• Aula de Informática.
• Servicio de despertador.
• Sala de TV y proyecciones – HD – DVD – Cine – Digital plus.
• Salón de Juegos: futbolín, diana, TV.
• Salón de Prensa: actualización diaria de periódicos y revistas. También se usa como Sala de conferencias.
• Sala de música, con equipo de música y piano electrónico. También se utiliza de Sala de reuniones.
• Acceso a Internet vía Wifi en todo el Centro.
• Préstamo de juegos de mesa.
• Préstamo de la equipación deportiva oficial del Colegio Mayor, así como demás material deportivo.
• Máquinas vending.
• Offices de Microondas.
• Baños adaptados.
• Habitaciones adaptadas.
• Lavandería autoservicio: dotada de lavadoras, secadoras y zona de plancha.
• Botiquín.
• Servicio de recepción: todos los días de 8:00 h. a 22:00 h.
• Servicio de vigilancia nocturna: todos los días de 22:00 h. a 8:00h.
• Servicio de mantenimiento.
• Casillero personal.
• Ascensor.
• Punto verde de reciclaje.